Die Es gibt eine zoologische Sammlung umfasst präparierte Vögel, Säugetiere, und 1.500 Reptilien, Amphibien, Fischen und sonstige Nasspräparaten sowie Insekten, Spinnen, Weichtieren, sonstige Wirbellose und DNA- und Gewebeproben.

Die botanische Sammlung umfasst botanische und mykologische Objekte, die geowissenschaftliche Sammlung umfasst Gesteine, Mineralien und Fossilien.

Das LWL-Museum für Naturkunde (vollständiger Name: LWL-Museum für Naturkunde, Westfälisches Landesmuseum mit Planetarium oder auch Westfälisches Museum für Naturkunde) in Münster ist ein Landesmuseum in der Trägerschaft des Landschaftsverband Westfalen-Lippe (LWL). Zu ihm gehören das Naturkundemuseum (Westfälisches Landesmuseum), das Planetarium, die Biologische Station in der Außenstelle Heiliges Meer, das in den Gemeinden Recke und Hopsten liegt, die Außenstelle Kahler Asten und die Paläontologische Bodendenkmalpflege für Westfalen-Lippe. Das Museum zeigt Exponate aus den Bereichen Biologie und Geologie, im Planetarium werden u. a. astronomische 360-Grad-Fulldome-Filme und Musikshows gezeigt.
Das Museum liegt in der Nachbarschaft des Allwetterzoos Münster und des Mühlenhof-Freilichtmuseum Münster am Aasee an der Sentruper Straße.

Der Museumsname durchlief im Laufe der Jahre mehrere Änderungen. So wurde aus dem „Provinzialmuseum für Naturkunde“ das „Westfälische Museum für Naturkunde – Landesmuseum und Planetarium“. Seit 2007 lautet der offizielle Name „LWL-Museum für Naturkunde – Westfälisches Landesmuseum mit Planetarium“.

Dem Museum gehören einige wissenschaftliche Sammlungen mit insgesamt über 2,3 Millionen Objekten, die zu Forschungszwecken oder als Ressource für die verschiedenen Ausstellungen benutzt werden. Dabei handelt es sich um die größte Sammlung Westfalens. Es gibt eine zoologische Sammlung mit rund 26.000 präparierten Vögeln (Bälge, Standpräparate, Skelette, Gelege, Federbilder), rund 13.000 Säugetieren und 1.500 Reptilien, Amphibien, Fischen und sonstigen Nasspräparaten sowie rund 1,125 Millionen Insekten, 100.000 Spinnen, 320.000 Weichtieren (Muscheln und Schnecken), 1.000 sonstigen Wirbellosen und rund 3.500 DNA- und Gewebeproben. Die geowissenschaftliche Sammlung umfasst 8.000 Gesteine, 15.000 Mineralien und 250.000 Fossilien. Die ethnologische Sammlung umfasst rund 1.000 Objekte. Die botanische Sammlung hat rund 500.000 botanische und mykologische Belege und ist damit das größte Herbarium Nordrhein-Westfalens.

Objekte, die gegenwärtig nicht in Ausstellungen gezeigt werden, werden im Zentralmagazin in der Speicherstadt in Coerde eingelagert. Dieses ist gelegentlich im Rahmen von Führungen für die Öffentlichkeit zugänglich.